l、菌種保藏(Culture Collection)具有雙重的意義，一是指對(duì)微生物菌種作妥善的保藏，以便隨時(shí)可以取用；二是指專門從事菌種保藏的機(jī)構(gòu)和組織。在科技發(fā)展的今日，菌種(Culture)及其保藏在范圍上已有很大的擴(kuò)展，因此，現(xiàn)在常用的組合詞，菌種保藏已意味著是指菌種及其相關(guān)生物材料的保藏。近年來，國內(nèi)外有關(guān)人士常將菌種的覆蓋面擴(kuò)大為生物資源(Biological resources)。菌種保藏機(jī)構(gòu)常稱作生物資源中心(BRC)，如美國模式培養(yǎng)物保藏中心(American Type Culture Collection)已自稱為全球生物資源中心(Global Biologicol Resouree Center)，這是該中心自認(rèn)為其對(duì)微生物資源的保藏和應(yīng)用具有全球性意義，事實(shí)上，也確實(shí)如此，該中心的微生物資源保藏量與保藏種類在世界上可說是首屈一指的，但是在微生物資源的保藏量上可能不一定如此。據(jù)說，從菌種保藏?cái)?shù)量上而言，有些大企業(yè)的擁有量可能超過ATCC。
    2、為了具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)，企業(yè)在微生物資源保藏量上數(shù)量龐大是因?yàn)槠髽I(yè)要從大量資源中作高通量篩選，每一獨(dú)立的候選資源都在一定時(shí)間內(nèi)涉及保藏問題，另一方面，對(duì)于主產(chǎn)品的微生物資源的保藏其要求和技術(shù)條件均十分苛刻，這是不難理解的。
    3、在我國，涉及微生物肥料的生物資源正在不斷的擴(kuò)大，資源的有效利用正在不斷的改善和提高，我國農(nóng)業(yè)部直接領(lǐng)導(dǎo)的“微生物肥料和食用菌菌種質(zhì)量監(jiān)督檢測中心”在推動(dòng)我國微生物肥料和食用菌的發(fā)展和質(zhì)量監(jiān)控方面作了許多有益的工作。北京九隆升微生物資源開發(fā)有限公司是一家專業(yè)從事農(nóng)用微生物系列產(chǎn)品開發(fā)的高新技術(shù)企業(yè)，公司本著自主創(chuàng)新的原則，多渠道搜求微生物資源，包括自主分離篩選、購買、交換和友情引進(jìn)，現(xiàn)在累集了可觀的數(shù)量，而且均有妥善的保藏。
    4、企業(yè)擁有的菌種，尤其是生產(chǎn)菌種的保藏與一般大規(guī)模的菌種保藏有別，對(duì)企業(yè)的生產(chǎn)菌種，要求確保存活，不污染和生產(chǎn)特性保持穩(wěn)定。第一，不言而喻，存活是首要的，第二，不污染是必須確保的，稍有疏忽被污染的菌種，如進(jìn)入下一步生產(chǎn)程序?qū)⒔o企業(yè)造成不可挽回的損失，確保不污染的菌種才能投入生產(chǎn)是企業(yè)的不二準(zhǔn)則，第三，生產(chǎn)特性保持穩(wěn)定具有雙向意義，菌種保藏妥善，其遺傳性狀保持穩(wěn)定，生產(chǎn)性能保持正常是保藏技術(shù)的問題，而生產(chǎn)工藝的穩(wěn)定則是發(fā)揮和再現(xiàn)菌種生產(chǎn)特性的必要條件，往往菌種保藏是妥善的，而生產(chǎn)工藝上出現(xiàn)了問題，如原料的改變影響了產(chǎn)量，生產(chǎn)過程中的污染而非菌種的原種被污染等等，發(fā)生此類情況，企業(yè)有關(guān)部門必須冷靜，實(shí)事求是的予以分析，找出確切原因，劃清責(zé)任，避免菌種室和生產(chǎn)車間之間的相互推諉，以辨別是非，杜絕事故，達(dá)到改進(jìn)生產(chǎn)的目的。
    5、微生物肥料的生產(chǎn)、應(yīng)用與其它微生物資源的利用如生產(chǎn)抗生素有別，后者是生產(chǎn)微生物的代謝產(chǎn)物，在生物資源上只需注意該資源的產(chǎn)出即可，即最終產(chǎn)物的質(zhì)與量。微生物肥料的生產(chǎn)當(dāng)然也有終產(chǎn)品是資源的代謝產(chǎn)物，如生物生長調(diào)節(jié)劑等等，但在許多情況下，資源的終產(chǎn)物是資源本身的擴(kuò)繁，并將終產(chǎn)品用于田間、水域等，而且要求它們在應(yīng)用的環(huán)境下發(fā)揮作用，這對(duì)資源(或稱作菌種)保持本性有更高的要求，一株經(jīng)久保藏和經(jīng)過多代移植的菌種用于微生物肥料的生產(chǎn)應(yīng)用，常常會(huì)出現(xiàn)施用于環(huán)境時(shí)的生態(tài)競爭能力下降，因此，菌種復(fù)壯就成為必要和微生物肥料生產(chǎn)中的特殊問題。一株抗生素產(chǎn)生菌需經(jīng)過復(fù)雜的選育過程，結(jié)果其選育株與原始菌種相比較，可能面目全非，但只要其產(chǎn)生的抗生素結(jié)構(gòu)穩(wěn)、產(chǎn)量高，那是可行的。但微生物肥料，特別是直接用有益菌施用作肥料的菌種，在菌種選育和應(yīng)用上就顯得另有要求，即最終的選育菌種必須在它們回歸到田間或水域時(shí)仍然是合格、有效的。